截至2018年底，江津区共有医疗卫生机构1125个。其中医院14个，在医院中有公立医院7个，民营医院7个；基层医疗卫生机构1107个，其中乡镇卫生院27个，社区卫生服务中心（站）1个，门诊部（所）253个，村卫生室826个；专业公共卫生机构4个，其中疾病预防控制中心1个，卫生和计划生育监督执法局1个。共有卫生技术人员5434人，其中执业医师和执业助理医师2241人，注册护士2131人。每千人口拥有执业（助理）医师1.61人，每千人口拥有注册护士1.53人。医疗卫生机构床位8051张，其中区级以上医院3689张，镇街卫生院3064张。

　　2018年全年全区无甲类传染病报告病例，乙类传染病报告病例3101例，发病率225.69/10万，乙类传染病中死亡病例99例，乙类传染病死亡率7.21/10万。报告死亡传染病病例100例，传染病死亡率7.28/10万。常规免疫报表适龄儿童（常住、流动）四苗（卡介苗、脊灰疫苗、百白破三联疫苗、麻疹疫苗）基础免疫接种率分别达99.98%、99.97%、99.98%、99.98%，四苗全程接种率为99.97%；乙肝疫苗首针及时接种率达98.24%，流脑疫苗、乙脑疫苗接种率分别为99.97%、99.98%。孕产妇系统管理率91.67%，新法接生率99.99%，住院分娩率99.99%，婴儿死亡率3.7‰。